石垣島位於日本琉球列島的八重山群島的南方,為八重山群島的政治、經濟、教育和交通中心,面積222.6平方公里是沖繩縣內僅次於沖繩島和西表島的第三大島,也是日本面積第21大島。岛上人口约4万5千人。行政上屬於沖繩縣石垣市,也是沖繩縣八重山支廳所在地。知名人物夏川里美出身于此岛。
雖然石垣島屬於沖繩縣,但距離沖繩縣廳所在地的那霸市有410公里的距離,離東京更是有近2,000公里的距離。在地理上,比起日本多數地區,反離台灣比較近,距離台灣只有270公里。
島中央為於茂登岳,海拔526公尺,是沖繩縣內的最高峰。石垣島南部多為珊瑚礁隆起的平地,人口多集中於此。